Trasa maratonu začíná i končí na Staroměstském náměstí. Zhruba 9000 účastníků poběží podél řeky přes Podolí, Smíchov a Libeň. Běh povede také přes Karlův most, památka bude proto v době průběhu závodníků uzavřená. Dopravní omezení se dotkne jak automobilové dopravy (zákaz vjezdu, zákaz parkování), tak i tramvajových a autobusových linek městské hromadné dopravy.
V ulicích, kterými povede 42 kilometrová trasa závodu, jsou umístěné dopravní značky oznamující zákaz parkování. Překážející vozy se budou odtahovat v noci na neděli. Omezení se budou týkat ulic Pařížská, Dlouhá, Celetná, Mostecká nebo Náměstí Jana Palacha. Ulice budou otevírány postupně, jak doběhnou poslední závodníci.Podrobnosti o uzavírkách lze najít na stránkách magistrátu. Informace poskytne i bezplatná linka 800 165 102.
Velké změny postihnou také městskou hromadnou dopravu. S omezením musí cestující počítat od 8.45 do 16.00. Tramvajovým linkám bude dočasně nepřístupné Strossmayerovo náměstí, Malostranská, Jiráskovo náměstí, Palmovka a okolí Národního divadla. Změnit trasu budou muset linky 9, 12, 17, 18, 22, 25 a řada dalších. Uzavřené lokality budou objíždět přes Výstaviště, Holešovice, Florenc, Letenské náměstí, Újezd a Václavské náměstí. Změny se dotknou i autobusových linek, konkrétně spojů 207 a 176. „Cestující by měli v centru města využívat především metra,“ sdělila mluvčí pražského dopravního podniku Monika Lojínová.